有机颜料在应用时，是以细微粒子状态散布于被着色的介质中，因而，颜料粒子的外形、大小、晶型和外表状态等物理结构和介质的不同都会影响入射光的反射、吸收和散射的比例，从而使颜料表现出不同色光和性能。

　　不异化学构造的颜料，其色光、牢度等各项性能各不相同，即便化学构造相同，但是由于颜料的物理结构不同，也会表现出不同性能，分子构造中氢键的构成和性能的关系在偶氮颜料中，重氮组分在氨基邻、对位有硝基、磺酸基、羧酸基、氯基等负性取代基团。


　　和巧合组分中酰氨基苯环的邻、对位有甲基、乙基、甲氧基、乙氧基等正性取代基团，都有增强氢键构成倾向，使颜料具有更好的坚牢度，例如，耐晒黄G、永固红FGR等都能构成分子内氢键构造，因而都有较好的耐光牢度。


　　增大颜料分子量和性能的关系增大颜料分子量能改良各项性能，例如在耐热、耐溶剂、耐迁移等性能上分子量为600~800的联苯胺黄比分子量小于400的耐晒黄，要好得多，分子构造中引入各种基团和性能的关系颜料分子构造中常引入酰氨基、磺酰胺、氯或其他卤素、磺酸或羧酸基、硝基团等。